В структуру национальных правозащитных учреждений Узбекистана входят Уполномоченный Олий Мажлиса Республики Узбекистан по правам человека (Омбудсман), Уполномоченный при Президенте Республики Узбекистан по защите прав и законных интересов субъектов предпринимательства и Национальный центр Республики Узбекистан по правам человека. Их работа организована и постоянно совершенствуется на основе международных стандартов в области прав человека и лучших международных практик.
Уполномоченный Олий Мажлиса Республики Узбекистан по правам человека (Омбудсман) – рассматривает и расследует жалобы на нарушения прав человека, рекомендует меры по устранению ошибок, допущенных отдельными организациями и должностными лицами, содействует восстановлению прав человека. Региональные представители Омбудсмана работают во всех регионах Узбекистана с 2000 года. Они значительно повысили эффективность работы Омбудсмана, рассматривая обращения граждан, а также в местах содержания под стражей, проводя свои собственные расследования, а также представляя информацию о правах человека на заседаниях местных советов.
Согласно постановлению Президента Республики Узбекистан «О дополнительных мерах по дальнейшему усилению гарантий прав ребенка» от 22 апреля 2019 года введена должность -Уполномоченного по правам ребенка.
Уполномоченный при Президенте Республики Узбекистан по защите прав и законных интересов субъектов предпринимательства служит для защиты прав и законных интересов субъектов предпринимательства. В обязанности уполномоченного входят содействие предпринимательству, участие в разработке и реализации государственной политики по защите прав и интересов предпринимателей, оказание им юридической поддержки при ведении предпринимательской деятельности, и подача исков в интересах предпринимателей, осуществление контроля за соблюдением прав и законных интересов субъектов предпринимательства государственными органами.
Среди национальных правозащитных учреждений Республики Узбекистан Национальный центр Республики Узбекистан по правам человека играет координирующую роль как на международном, так и на национальном уровне. Национальный центр Республики Узбекистан по правам человека является государственным органом, который обеспечивает сотрудничество между государственными органами и другими организациями в выполнении международных обязательств Республики Узбекистан в области прав человека, подготовке национальных докладов и расширении сотрудничества с международными правозащитными организациями. Центр осуществляет свои полномочия независимо от всех государственных органов и организаций, их должностных лиц. Центр ежегодно представляет Президенту Республики Узбекистан, Палатам Олий Мажлиса Республики Узбекистан и Кабинету Министров информацию о соблюдении международных обязательств Республики Узбекистан в области прав человека. Центр содействует деятельности государственных органов, институтов гражданского общества, образовательных, исследовательских и других организаций по выполнению международных обязательств Республики Узбекистан в области прав человека.